翻訳停滞解消因子YhdLの機能・構造解析

内容

 細胞内ではタンパク合成中にリボソームがmRNA上で停滞することが知られています。原核生物・真核生物を問わず、細胞はこのような異常事態を解決するシステムを有しています。
 バクテリアにおけるリボソームの停滞解消について、最近、新しいシステムの存在が明らかになりました。YhdLのシステイン残基にラジカル発生試薬を結合させ、ラジカルによる切断部位を逆転写酵素で解析しました。タンパク質とRNAの相対的位置関係をマッピングしました。YhdLのシステイン残基にクロスリンカーを結合させ、UVを照射し、周囲のタンパク質と架橋させ、標的の検出に成功しました。相手のタンパク質はRF2あるいはリボソームタンパク質であると推測され、今後は質量分析とウエスタンプロットで標的を特定する予定です。